Optimer entwickelt neue Antibiotika-Wirkstoffkandidaten. Das wichtigste Leitmedikament des Unternehmens ist Fidaxomicin, ein neuartiges selektives Antibiotikum gegen Clostridium-difficile-Bakterien, die bei hospitalisierten Patienten eine schwere oder gar tödlich verlaufende Diarrhoe hervorrufen können. Der Wirkstoff ist dahingehend optimiert, dass nur Clostridium-difficile-Bakterien getötet werden, wodurch die nützlichen Bakterien der Darmflora erhalten bleiben. Dieser neuartige Ansatz unterscheidet sich grundlegend von den herkömmlichen Antibiotika, die in der Regel sämtliche Bakterien vernichten, was oft zu Rückfällen führt.
Optimer hat im vergangenen Herbst sehr erfreuliche Daten von zwei Phase-III-Studien zu Fidaxomicin vorgelegt, die eine signifikante Rückfallreduktion gegenüber Vancomycin aufweisen. Damit wird Fidaxomicin möglicherweise zum wirksamsten Mittel gegen diese Krankheit. In Anbetracht dieser positiven Daten hat Optimer daher 2010 die Zulassung des Präparats in Europa und in den USA beantragt. Eine Zulassung wäre Mitte 2011 möglich. Optimer will die Lancierung des Medikaments in den USA in Eigenregie durchführen und für die Vermarktung in Europa einen Partner suchen. Das Unternehmen verfügt über ein weiteres Produkt, nämlich Prulifloxacin, für das es positive Daten entsprechender Phase-III Studien präsentieren konnte.